MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) chromosome

Total Repeats: 3739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017259	TAA	4	12	24	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017259	TAT	3	9	37	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017259	T	15	15	45	59	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017259	AATT	2	8	60	67	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017259	TAAAAA	2	12	85	96	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017259	A	8	8	92	99	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017259	T	7	7	104	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017259	TTAA	2	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017259	TAA	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017259	TAA	2	6	2120	2125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017259	TTAA	2	8	2131	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017259	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017259	AAT	3	9	2184	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017259	T	8	8	2222	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017259	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017259	A	6	6	2266	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017259	A	6	6	3125	3130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017259	T	8	8	3390	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017259	TA	3	6	3403	3408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017259	TGT	2	6	3433	3438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017259	TTTG	2	8	3440	3447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017259	TAA	2	6	3454	3459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017259	T	7	7	3470	3476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017259	AAT	2	6	4545	4550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017259	TCA	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017259	TAA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017259	A	7	7	8431	8437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017259	A	6	6	8912	8917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017259	TAT	2	6	8918	8923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017259	T	6	6	11356	11361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017259	ATT	2	6	11384	11389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017259	TAA	2	6	13893	13898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017259	TA	3	6	13927	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017259	AT	4	8	13942	13949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017259	ATATA	2	10	14036	14045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017259	TATTT	2	10	14055	14064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017259	AAG	2	6	14070	14075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017259	TAT	2	6	14094	14099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017259	TAA	2	6	14100	14105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017259	TCA	2	6	14114	14119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017259	T	8	8	14144	14151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017259	ATTC	2	8	14158	14165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017259	AT	3	6	14169	14174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017259	TA	4	8	14206	14213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017259	AAT	2	6	14254	14259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017259	T	7	7	14287	14293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017259	TTA	2	6	14467	14472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017259	TAT	2	6	14826	14831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017259	ATT	2	6	14844	14849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017259	TTAT	3	12	14898	14909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017259	TAA	2	6	14919	14924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017259	AT	3	6	14929	14934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017259	ATA	2	6	14965	14970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017259	TTAAAA	2	12	14981	14992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017259	ATA	2	6	18067	18072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017259	ACC	2	6	18097	18102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017259	AT	4	8	18154	18161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017259	TAT	2	6	18213	18218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017259	ATT	2	6	18223	18228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017259	TAAA	2	8	18238	18245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017259	TA	4	8	18274	18281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017259	ATAAAA	2	12	18284	18295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017259	AAT	2	6	18296	18301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017259	AT	3	6	18332	18337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017259	A	7	7	18381	18387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017259	AATTA	2	10	18389	18398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017259	TTA	2	6	18746	18751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017259	ATTT	2	8	20418	20425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017259	T	9	9	20423	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017259	GAT	3	9	20432	20440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017259	AATT	2	8	20445	20452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017259	TTTA	2	8	20473	20480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017259	ATA	2	6	20509	20514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017259	CAA	2	6	20516	20521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017259	T	6	6	20529	20534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017259	A	6	6	20538	20543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017259	ATA	2	6	20555	20560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017259	TA	3	6	20559	20564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017259	TTA	2	6	20572	20577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017259	T	6	6	22422	22427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017259	T	6	6	23058	23063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017259	ATTT	2	8	23078	23085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017259	ATTTTT	2	12	23088	23099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017259	A	6	6	23111	23116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017259	TGAAAT	2	12	23126	23137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017259	AT	3	6	23136	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017259	TAT	2	6	23148	23153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017259	AT	3	6	23156	23161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017259	ATG	2	6	24283	24288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017259	TGAA	2	8	24307	24314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017259	TAT	2	6	24355	24360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017259	AT	3	6	24359	24364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017259	TAA	2	6	24378	24383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017259	TA	3	6	24389	24394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017259	AAT	2	6	25280	25285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017259	TAAT	2	8	25369	25376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017259	TAA	2	6	25390	25395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017259	T	6	6	27244	27249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017259	AT	3	6	27256	27261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017259	TATT	2	8	27262	27269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017259	AAAT	2	8	27272	27279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017259	TGT	2	6	27294	27299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017259	TATAAA	2	12	28714	28725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017259	T	6	6	28760	28765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017259	T	6	6	28768	28773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017259	TA	3	6	28789	28794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017259	AT	3	6	28822	28827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017259	TAA	2	6	28832	28837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017259	AT	3	6	28839	28844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017259	T	6	6	28847	28852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017259	TAA	2	6	29690	29695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017259	TTTTA	2	10	29698	29707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017259	TAT	2	6	29721	29726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017259	AT	3	6	29725	29730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017259	AATA	2	8	29731	29738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017259	TAG	2	6	29742	29747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017259	T	6	6	29783	29788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017259	T	8	8	29798	29805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017259	TA	4	8	29811	29818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017259	ATGTT	2	10	29824	29833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017259	TTG	2	6	29854	29859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017259	TAAT	2	8	29871	29878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017259	T	6	6	29878	29883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017259	AAT	2	6	29886	29891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017259	TTA	2	6	29892	29897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017259	T	6	6	29925	29930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017259	AATTA	2	10	29931	29940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017259	A	6	6	29944	29949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017259	AT	3	6	29954	29959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017259	A	6	6	29997	30002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017259	TA	3	6	30009	30014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017259	TAT	2	6	30022	30027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017259	TAA	2	6	30044	30049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017259	ATA	2	6	30058	30063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017259	T	7	7	30064	30070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017259	A	9	9	30071	30079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017259	TAT	2	6	30080	30085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017259	AAT	2	6	30093	30098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017259	AAT	2	6	30101	30106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017259	TAA	2	6	30126	30131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017259	TAAATA	2	12	30137	30148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017259	ATT	2	6	30166	30171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017259	T	6	6	30170	30175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017259	ATT	3	9	30177	30185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017259	ATC	2	6	30188	30193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017259	AT	3	6	30196	30201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017259	TA	4	8	30235	30242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017259	ATT	3	9	30299	30307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017259	TGA	2	6	30310	30315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017259	TATTT	2	10	30326	30335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017259	T	8	8	30333	30340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017259	TAA	2	6	30359	30364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_017259	TTA	2	6	71877	71882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017259	TAA	2	6	71891	71896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_017259	TGA	2	6	71923	71928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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